Wśród przeciwwskazań bezwzględnych wymienia się: uczulenie na środek obliterujący; ostrą zakrzepicę żył głębokich (DVT) i zatorowość płucną (PE); zakażenie tkanek w okolicy wkłucia, ciężką infekcję ogólnoustrojową; długotrwałe unieruchomienie (w łóżku). W przypadku skleroterapii pianą powinno się uwzględnić dodatkowe przeciwwskazanie: przetrwały otwór owalny (PFO). U pacjentów z przeciwwskazaniami względnymi do skleroterapii ryzyko należy oceniać indywidualnie dla każdego przypadku. Do przeciwwskazań względnych należą: ciąża, karmienie piersią (po zabiegu przez 2-3 dni nie należy karmić piersią); miażdżyca tętnic kończyn dolnych; zły stan ogólny pacjenta, ciężkie choroby ogólnoustrojowe; silna predyspozycja do alergii, poważne reakcje alergiczne w wywiadzie; duże ryzyko zakrzepowo-zatorowe (np. incydenty zakrzepowo-zatorowe w wywiadzie, trombofilia, choroba nowotworowa); ostra zakrzepica żył powierzchownych. W przypadku skleroterapii pianą dodatkowymi przeciwwskazaniami względnymi są zaburzenia neurologiczne (w tym migrena po uprzedniej skleroterapii pianą).